A Pró-Reitoria de Ensino (Proens) é responsável pelo planejamento, superintendência, coordenação e fomento das políticas e acompanhamento da execução das atividades de ensino, na área de educação profissional e tecnológica, de graduação e pós-graduação, articuladas com a extensão, pesquisa, o empreendedorismo e a inovação tecnológica no âmbito do IFPR.
Os cursos do IFPR são organizados por eixos tecnológicos, nas modalidades presencial e a distância e nos seguintes níveis de ensino: